added CMake configuration files

eo/src/CMakeLists.txt

@@ -0,0 +1,71 @@
+
+######################################################################################
+### 1) Include the sources
+######################################################################################
+
+INCLUDE_DIRECTORIES(${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR})
+
+######################################################################################
+
+
+
+######################################################################################
+### 2) Define the eo target
+######################################################################################
+
+SET(EO_LIB_OUTPUT_PATH ${EO_BINARY_DIR}/lib)
+SET(LIBRARY_OUTPUT_PATH ${EO_LIB_OUTPUT_PATH})
+
+SET (EO_SOURCES     eoFunctorStore.cpp 
+					eoPersistent.cpp 
+					eoPrintable.cpp 
+					eoCtrlCContinue.cpp 
+					eoParetoFitness.cpp 
+					eoScalarFitnessAssembled.cpp)
+
+ 
+ADD_LIBRARY(eo STATIC ${EO_SOURCES})
+
+######################################################################################
+
+
+
+######################################################################################
+### 3) Optionnal: define your target(s)'s version: no effect for windows
+######################################################################################
+
+SET(EO_VERSION "1.0.1")
+SET_TARGET_PROPERTIES(eo PROPERTIES VERSION "${EO_VERSION}")
+######################################################################################
+
+
+
+######################################################################################
+### 4) Windows advanced config - especially for Microsoft Visual Studio 8
+######################################################################################
+
+  IF(CMAKE_CXX_COMPILER MATCHES cl)
+   IF(NOT WITH_SHARED_LIBS)
+     IF(CMAKE_GENERATOR STREQUAL "Visual Studio 8 2005")
+       SET(CMAKE_CXX_FLAGS "/nologo /W3 /Gy")
+       SET(CMAKE_CXX_FLAGS_DEBUG "/MTd /Z7 /Od")
+       SET(CMAKE_CXX_FLAGS_RELEASE "/MT /O2")
+       SET(CMAKE_CXX_FLAGS_MINSIZEREL "/MT /O2")
+       SET(CMAKE_CXX_FLAGS_RELWITHDEBINFO "/MTd /Z7 /Od")
+       SET(CMAKE_EXE_LINKER_FLAGS "${CMAKE_EXE_LINKER_FLAGS} /SUBSYSTEM:CONSOLE")
+       
+     ENDIF(CMAKE_GENERATOR STREQUAL "Visual Studio 8 2005")
+   ENDIF(NOT WITH_SHARED_LIBS)
+  ENDIF(CMAKE_CXX_COMPILER MATCHES cl)
+######################################################################################
+
+
+
+######################################################################################
+### 5) Where must cmake go now ?
+######################################################################################
+
+SUBDIRS(do es ga gp other utils) # forget pyeo for the moment
+
+######################################################################################
+

eo/src/do/CMakeLists.txt

@@ -0,0 +1,2 @@
+
+## Nothing to generate here

eo/src/es/CMakeLists.txt

@@ -0,0 +1,79 @@
+
+######################################################################################
+### 1) Include the sources
+######################################################################################
+
+INCLUDE_DIRECTORIES(${EO_SOURCE_DIR}/src)
+INCLUDE_DIRECTORIES(${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR})
+
+######################################################################################
+
+
+######################################################################################
+### 2) Define the es and cma targets
+######################################################################################
+
+SET(ES_LIB_OUTPUT_PATH ${EO_BINARY_DIR}/lib)
+SET(CMA_LIB_OUTPUT_PATH ${EO_BINARY_DIR}/lib)
+
+SET(LIBRARY_OUTPUT_PATH ${ES_LIB_OUTPUT_PATH}) # the same output for the two libs
+
+SET (ES_SOURCES 	make_algo_scalar_es.cpp
+					make_algo_scalar_real.cpp 
+					make_checkpoint_es.cpp 
+					make_checkpoint_real.cpp 
+					make_continue_es.cpp 
+					make_continue_real.cpp 
+					make_genotype_es.cpp 
+					make_genotype_real.cpp 
+					make_op_es.cpp 
+					make_op_real.cpp 
+					make_pop_es.cpp 
+					make_pop_real.cpp 
+					make_run_es.cpp 
+					make_run_real.cpp)
+				
+SET (CMA_SOURCES 	eig.cpp
+					CMAState.cpp
+					CMAParams.cpp)
+
+ 
+ADD_LIBRARY(es STATIC ${ES_SOURCES})
+ADD_LIBRARY(cma STATIC ${CMA_SOURCES})
+
+######################################################################################
+
+
+
+######################################################################################
+### 3) Optionnal
+######################################################################################
+
+SET(ES_VERSION "1.0.1")
+SET_TARGET_PROPERTIES(es PROPERTIES VERSION "${ES_VERSION}")
+
+SET(CMA_VERSION "1.0.1")
+SET_TARGET_PROPERTIES(cma PROPERTIES VERSION "${CMA_VERSION}")
+######################################################################################
+
+
+
+######################################################################################
+### 4) Windows advanced config - especially for Microsoft Visual Studio 8
+######################################################################################
+
+  IF(CMAKE_CXX_COMPILER MATCHES cl)
+   IF(NOT WITH_SHARED_LIBS)
+     IF(CMAKE_GENERATOR STREQUAL "Visual Studio 8 2005")
+       SET(CMAKE_CXX_FLAGS "/nologo /W3 /Gy")
+       SET(CMAKE_CXX_FLAGS_DEBUG "/MTd /Z7 /Od")
+       SET(CMAKE_CXX_FLAGS_RELEASE "/MT /O2")
+       SET(CMAKE_CXX_FLAGS_MINSIZEREL "/MT /O2")
+       SET(CMAKE_CXX_FLAGS_RELWITHDEBINFO "/MTd /Z7 /Od")
+       SET(CMAKE_EXE_LINKER_FLAGS "${CMAKE_EXE_LINKER_FLAGS} /SUBSYSTEM:CONSOLE")
+       
+     ENDIF(CMAKE_GENERATOR STREQUAL "Visual Studio 8 2005")
+   ENDIF(NOT WITH_SHARED_LIBS)
+  ENDIF(CMAKE_CXX_COMPILER MATCHES cl)
+######################################################################################
+

eo/src/ga/CMakeLists.txt

@@ -0,0 +1,61 @@
+
+######################################################################################
+### 1) Include the sources
+######################################################################################
+
+INCLUDE_DIRECTORIES(${EO_SOURCE_DIR}/src)
+INCLUDE_DIRECTORIES(${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR})
+######################################################################################
+
+
+######################################################################################
+### 2) Define the ga target
+######################################################################################
+
+SET(GA_LIB_OUTPUT_PATH ${EO_BINARY_DIR}/lib)
+SET(LIBRARY_OUTPUT_PATH ${GA_LIB_OUTPUT_PATH})
+
+SET (GA_SOURCES 	make_algo_scalar_ga.cpp
+					make_checkpoint_ga.cpp
+					make_continue_ga.cpp
+					make_genotype_ga.cpp
+					make_op_ga.cpp
+					make_pop_ga.cpp
+					make_run_ga.cpp)
+
+
+ADD_LIBRARY(ga STATIC ${GA_SOURCES})
+######################################################################################
+
+
+
+######################################################################################
+### 3) Optionnal
+######################################################################################
+
+SET(GA_VERSION "1.0.1")
+SET_TARGET_PROPERTIES(ga PROPERTIES VERSION "${GA_VERSION}")
+
+######################################################################################
+
+
+
+######################################################################################
+### 4) Windows advanced config - especially for Microsoft Visual Studio 8
+######################################################################################
+
+  IF(CMAKE_CXX_COMPILER MATCHES cl)
+   IF(NOT WITH_SHARED_LIBS)
+     IF(CMAKE_GENERATOR STREQUAL "Visual Studio 8 2005")
+       SET(CMAKE_CXX_FLAGS "/nologo /W3 /Gy")
+       SET(CMAKE_CXX_FLAGS_DEBUG "/MTd /Z7 /Od")
+       SET(CMAKE_CXX_FLAGS_RELEASE "/MT /O2")
+       SET(CMAKE_CXX_FLAGS_MINSIZEREL "/MT /O2")
+       SET(CMAKE_CXX_FLAGS_RELWITHDEBINFO "/MTd /Z7 /Od")
+       SET(CMAKE_EXE_LINKER_FLAGS "${CMAKE_EXE_LINKER_FLAGS} /SUBSYSTEM:CONSOLE")
+       
+     ENDIF(CMAKE_GENERATOR STREQUAL "Visual Studio 8 2005")
+   ENDIF(NOT WITH_SHARED_LIBS)
+  ENDIF(CMAKE_CXX_COMPILER MATCHES cl)
+######################################################################################
+

eo/src/gp/CMakeLists.txt

@@ -0,0 +1,3 @@
+
+## Nothing to generate here
+

eo/src/obsolete/CMakeLists.txt

@@ -0,0 +1,56 @@
+
+######################################################################################
+### 1) Include the sources
+######################################################################################
+
+INCLUDE_DIRECTORIES(${EO_SOURCE_DIR}/src)
+INCLUDE_DIRECTORIES(${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR})
+
+######################################################################################
+
+
+######################################################################################
+### 2) Define the ga target
+######################################################################################
+
+SET(EOOBSOLETE_LIB_OUTPUT_PATH ${EO_BINARY_DIR}/lib)
+SET(LIBRARY_OUTPUT_PATH ${EOOBSOLETE_LIB_OUTPUT_PATH})
+
+SET (EOOBSOLETE_SOURCES eoParserUtils.cpp)
+
+
+ADD_LIBRARY(eoobsolete STATIC ${EOOBSOLETE_SOURCES}) 
+######################################################################################
+
+
+
+######################################################################################
+### 3) Optionnal
+######################################################################################
+
+SET(EOOBSOLETE_VERSION "1.0.1")
+SET_TARGET_PROPERTIES(eoobsolete PROPERTIES VERSION "${EOOBSOLETE_VERSION}")
+
+######################################################################################
+
+
+
+######################################################################################
+### 4) Windows advanced config - especially for Microsoft Visual Studio 8
+######################################################################################
+
+  IF(CMAKE_CXX_COMPILER MATCHES cl)
+   IF(NOT WITH_SHARED_LIBS)
+     IF(CMAKE_GENERATOR STREQUAL "Visual Studio 8 2005")
+       SET(CMAKE_CXX_FLAGS "/nologo /W3 /Gy")
+       SET(CMAKE_CXX_FLAGS_DEBUG "/MTd /Z7 /Od")
+       SET(CMAKE_CXX_FLAGS_RELEASE "/MT /O2")
+       SET(CMAKE_CXX_FLAGS_MINSIZEREL "/MT /O2")
+       SET(CMAKE_CXX_FLAGS_RELWITHDEBINFO "/MTd /Z7 /Od")
+       SET(CMAKE_EXE_LINKER_FLAGS "${CMAKE_EXE_LINKER_FLAGS} /SUBSYSTEM:CONSOLE")
+       
+     ENDIF(CMAKE_GENERATOR STREQUAL "Visual Studio 8 2005")
+   ENDIF(NOT WITH_SHARED_LIBS)
+  ENDIF(CMAKE_CXX_COMPILER MATCHES cl)
+######################################################################################
+

eo/src/other/CMakeLists.txt

@@ -0,0 +1,2 @@
+
+## Nothing to generate

eo/src/utils/CMakeLists.txt

@@ -0,0 +1,69 @@
+
+######################################################################################
+### 1) Include the sources
+######################################################################################
+
+INCLUDE_DIRECTORIES(${EO_SOURCE_DIR}/src)
+INCLUDE_DIRECTORIES(${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR})
+
+######################################################################################
+
+
+######################################################################################
+### 2) Define the ga target
+######################################################################################
+
+SET(EOUTILS_LIB_OUTPUT_PATH ${EO_BINARY_DIR}/lib)
+SET(LIBRARY_OUTPUT_PATH ${EOUTILS_LIB_OUTPUT_PATH})
+
+SET (EOUTILS_SOURCES 	eoData.cpp
+						eoFileMonitor.cpp
+						eoGnuplot.cpp
+						eoGnuplot1DMonitor.cpp
+						eoGnuplot1DSnapshot.cpp
+						eoIntBounds.cpp
+						eoParser.cpp
+						eoRealBounds.cpp
+						eoRNG.cpp
+						eoState.cpp
+						eoStdoutMonitor.cpp
+						eoUpdater.cpp
+						make_help.cpp
+						pipecom.cpp)
+
+
+ADD_LIBRARY(eoutils STATIC ${EOUTILS_SOURCES})
+######################################################################################
+
+
+
+######################################################################################
+### 3) Optionnal
+######################################################################################
+
+SET(EOUTILS_VERSION "1.0.1")
+SET_TARGET_PROPERTIES(eoutils PROPERTIES VERSION "${EOUTILS_VERSION}")
+
+######################################################################################
+
+
+
+######################################################################################
+### 4) Windows advanced config - especially for Microsoft Visual Studio 8
+######################################################################################
+
+  IF(CMAKE_CXX_COMPILER MATCHES cl)
+   IF(NOT WITH_SHARED_LIBS)
+     IF(CMAKE_GENERATOR STREQUAL "Visual Studio 8 2005")
+       SET(CMAKE_CXX_FLAGS "/nologo /W3 /Gy")
+       SET(CMAKE_CXX_FLAGS_DEBUG "/MTd /Z7 /Od")
+       SET(CMAKE_CXX_FLAGS_RELEASE "/MT /O2")
+       SET(CMAKE_CXX_FLAGS_MINSIZEREL "/MT /O2")
+       SET(CMAKE_CXX_FLAGS_RELWITHDEBINFO "/MTd /Z7 /Od")
+       SET(CMAKE_EXE_LINKER_FLAGS "${CMAKE_EXE_LINKER_FLAGS} /SUBSYSTEM:CONSOLE")
+       
+     ENDIF(CMAKE_GENERATOR STREQUAL "Visual Studio 8 2005")
+   ENDIF(NOT WITH_SHARED_LIBS)
+  ENDIF(CMAKE_CXX_COMPILER MATCHES cl)
+######################################################################################
+